Kartläggningen av gener, som är en förutsättning för precisionsmedicin, utvecklas snabbt i Sverige och internationellt. Genomic Medicine Sweden är det nationella paraplyet för sju regionala center, knutna till forskning och sjukvård vid de sju medicinska fakulteterna i landet. På ett symposium den 28 maj gavs även utblickar till Storbritannien.
Mark Caulfield är chefsforskare och ansvarig för Genomics England, en offentligt finansierad organisation som startade 2013. Eftersom kartläggningen görs på 13 olika center runt om i landet var standardisering av processerna centrala. Utan standardisering blir det omöjligt att sätta samman data från de olika centren.
– Vi standardiserade allt från sättet att rekrytera patienter, beskriva patienterna, hanteringen och analyserna av prover, till hur vi skulle använda data för att uppnå hälsofördelar, sade han.
Syftet när projektet inleddes var att kartlägga genomet hos 100 000 personer.
– Vi har i dagsläget sekvenserat 110 000 genom och antalet ökar dag för dag. Cirka 25 000 rör cancerpatienter och 85 000 är från patienter med sällsynta sjukdomar. Det finns 1 200 sällsynta tillstånd med medicinska behov som inte sjukvården klarar. Med genkartläggning har vi redan kunnat ge patienter bättre vård. Jag säger inte att vi kan hjälpa alla, men för en del är genkartläggningen livsavgörande.
Kan spara lidande och pengar
Och även om man inte alltid kan erbjuda en behandling så är möjligheten till en diagnos för ett sjukt barn positivt för föräldrarna. Patienter som inte får en diagnos utsätts inte bara för lidande. Även vårdkostnaden kan bli hög. Genkartläggning som leder till en diagnos kan spara pengar. Mark Caulfield berättade om en flicka som före sin 4-årsdag haft kontakt med sjukvård 151 gånger inom tio olika specialiteter till en vårdkostnad på motsvarande drygt 400 000 kronor utan att få en diagnos.
– Flickan har idag fått en diagnos och vi har kunnat visa att kostnaderna minskat med åtminstone 20 procent tack vare färre vårdbesök. Tänker vi så framstår genomkartläggning som kostnadseffektivt.
Genkartläggning kan innebära flera fördelar för enskilda patienter och anhöriga, konstaterade Mark Caulfield. För en del genförändringar vid cancer finns läkemedel som riktas direkt mot den skadliga genförändringen. En annan fördel kan vara att den som bär på en gen som innebär en hög framtida risk kan göra kirurgiska ingrepp innan tumörsjukdomen har uppträtt – till exempel borttagning av äggstockar eller bröstvävnad hos kvinnor med högriskgener.
Data från genkartläggning av patienter kan dessutom användas för att hitta personer som uppfyller kraven för att engageras i kliniska prövningar av läkemedelskandidater i framtiden. Det kan finnas mutationer där det idag saknas målinriktade läkemedel men där forskningen kan få fram nya läkemedel framöver. Finns det då en grupp personer med denna genförändring kan kliniska prövningar komma igång snabbare.
Påverka läkemedelsanvändningen
Ett annat område där information från genkartläggning är värdefullt är läkemedelsanvändning. Mutationer i enzymsystem som påverkar nedbrytningen av läkemedel i levern kan kraftigt påverka hur effektiva, eller ineffektiva, vissa läkemedel är hos en patient.
– Av våra sjukhusinläggningar beror sju procent på läkemedelsbiverkningar. Att kartlägga interaktioner mellan våra gener och läkemedel är därför ett angeläget område, både medicinskt och hälsoekonomiskt. Av 6 628 testade genuppsättningar fanns genförändringar som påverkar läkemedelsnedbrytningen hos 5 669. Hos fyra av tio fanns förändringar som påverkar dosen av warfarin i kroppen.
Klopidogrel är ett vanligt läkemedel för att förhindra blodproppar hos personer med hjärt-kärlsjukdom. I data från Genomics England hade nästan en tredjedel av patienterna en genuppsättning som innebar att de riskerade hjärtinfarkt och andra hjärt-kärlhändelser på grund av utebliven effekt av läkemedlet.
En liten del av patienter som använder en salva mot svåra hudinfektioner som innehåller takrolimus kan behöva högre dos för att få effekt av läkemedlet. Knappt en procent av patienter som behandlas med cancermedlet fluorouracil riskerar att skadas svårt eller till och med avlida på grund av sin genuppsättning.